農村能源供需矛盾雖基本得到了改善，但距離小康水平的能源需求仍有較大的差距。日前，農村居民的生活用能中約50%仍然依靠秸稈、薪柴等直接燃燒，優質能源的比例很低，能源結構極不合理。這種落后的用能方式嚴重污染了室內外空氣質最，危害人民身心健康，影響人們的生活質量。過度依賴秸稈、薪柴還造成森林等生態林草植被資源的破壞。秸稈中氮、磷、鉀等元素和有機質難以還田，也降低了土壤肥力。此外，還有約2萬個村、800多萬戶、約3000萬人沒有電力供應，處于刀耕火種的狀態。
農村生物質能資源品種多、數量大、分布廣，每年產生農作物秸稈6億多噸，農產品加工業廢棄物（包括稻殼、玉米芯、花生殼及甘蔗渣等）超過l億噸；畜禽糞便以及農產品加工業有機廢水約18億余噸，理論上可以生產沼氣超過700億米3；另有用于開發能源作物的邊際土地16.57億畝，其中荒草地資源7.4億畝，鹽堿荒地1.5億畝。由于技術缺乏、資金短缺和意識落后的限制，大量農村生物質未被有效利用。
在新農村建設進程中，隨著農村居民生活用能向商品能源的轉變，將需要大量的能源。如果農村生活用能能夠做到自給，不僅將改善農民生活質量，而且將有力地緩解中國能源緊張局面，保障國家能源安全。
截至2004年底，農村地區已累計推廣省柴節煤爐灶1.90億戶．極大緩解了農村能源短缺的緊張局面，省柴節煤爐灶普及率達到70%以上。生物質燃燒發電也具有一定的規模，主要集中在南方地區許多糖廠利用甘蔗渣發電。廣東和廣西共有小型發電機組300余臺，總裝機容量800兆瓦，云南省也有一些甘蔗渣電廠。此外，中國第一批秸稈生物燃燒發電廠將在河北省石家莊、晉州市和山東省菏澤市單縣建設。
在廣大農村地區，因地制宜地發展r組合太陽能、沼氣等多種技術而形成了小規模庭院式的能源一生態組合技術。以“四位一體”“二位一體”等模式為主，組合了厭氧消化的沼氣技術和太陽能熱利用技術，充分利用農村生物質能。2004年戶用沼氣池新增280萬戶，累計達1541萬戶，總產氣量達55.68億米3，每年可替代800多萬噸秸稈和薪柴，相當于420多萬噸標準煤。同時，建成畜禽養殖場糞尿無害化處理T程2 676處，城鎮生活污水凈化系統13.7萬處。
各省區市和90%以上縣的農業主管部門設有農村能源管理和推廣機構+人員超過5萬人，負責沼氣建設的組織實施、建設管理、技術推廣及培訓服務，有15萬多名農民技術員獲得了農業部頒發的“沼氣生產工”國家職業資格證書，有50多家企業生產沼氣配套產品，年生產能力達到500萬套。
由于糧食安全與能源安全同樣嚴重，我國政府從“十一五”計劃開始，鼓勵利用非糧食原料生產生物質液體燃料，逐步減少和替代化石資源的過量井發。國家也鼓勵和支持開發閑置荒地和大片鹽堿地種植能源作物，開發生物質液體燃料資源。我國已頒布了《變性燃料乙醇》和《車用乙醇汽油》兩項產品國家標準。原國家汁委批準四個示范工程，分別在黑龍江省（年產10萬噸）、吉林省（年產30萬噸）、河南省（年產30萬噸）和安徽省（年產36萬噸）四省進行示范，以陳化糧為原料生產燃料乙醇，并由石油部門合成車用乙醇汽油在當地加油站試點銷售。自2002年6月30口起，開展了為期一年的車用乙醇汽油使用試點工作，并將在黑龍江、吉林、遼寧、河南和安徽5省及湖北、山東、河北和江蘇4省的部分地區開展車用乙醇汽油擴大試點工作，到2005年底，這些地區已基本實現車用乙醇汽油替代其他汽油。
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